Colecţia de drapele cuprinde peste 10 000 de  obiecte, fiind  cea mai importantă de acest gen din ţară și printre cele mai vechi a Muzeului Militar Național Regele Ferdinand I; știința care se ocupă cu studierea acestor piese se numește vexilologie.

Colecţia cuprinde drapele şi stindarde româneşti şi străine care se pot împărţi în: stindarde / drapele militare româneşti (între acestea fiind: toate drapelele şi stindardele armatei române de la 1834 până astăzi, drapele ale unor organizaţii cu caracter militar, pavilioane regale, fanioane, flamuri, jaloane, drapele folosite la încoronarea  regilor Ferdinand şi Maria în 1922 la Alba Iulia, precum și reconstituiri după diferite modele de drapele româneşti, accesorii pentru drapele, etc), steaguri şi fanioane străine.

Constituirea colecţiei s-a realizat cu concursul unor instituţii, dintre care pot fi amintite: Arsenalul Armatei, Palatul Regal, Depozitul Central de Echipament, Comandamentul Marinei Militare, Inspectoratele de arme, Academia Militară (actuala Universitate Naţională de Apărare Regele Carol I), diferitele structuri ale Ministerului de Război şi al Apărării şi, nu în ultimul rând, al corpurilor de trupă din compunerea acestora.

Printre cele mai valoroase piese aflate în colecţie sunt de menţionat  drapelul cu însemnele domnitorului Constantin Ipsilanti, datând de la începutul secolului al XIX-lea, primele drapele militare instituite de Mihai Sturdza în Moldova şi Grigore Dimitrie Ghica în Ţara Românească la 1834, apoi cele ale lui Barbu Ştirbei şi Grigore Alexandru Ghica, Alexandru Ioan I (Cuza), Carol I, Ferdinand I, Carol II, Mihai I şi unele drapele străine (otomane, austro-ungare, etc.) din secolele al XIX-lea-al XX-lea.